MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ5

Total Repeats: 810

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010479	GCGGGA	2	12	29	40	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	170079514
2	NC_010479	CGA	2	6	88	93	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079514
3	NC_010479	GAA	2	6	151	156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079514
4	NC_010479	GCC	2	6	159	164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079514
5	NC_010479	TGAT	2	8	242	249	25 %	50 %	25 %	0 %	170079514
6	NC_010479	TCCAG	2	10	312	321	20 %	20 %	20 %	40 %	170079514
7	NC_010479	GCA	2	6	343	348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079514
8	NC_010479	TCA	2	6	410	415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079514
9	NC_010479	AAG	2	6	581	586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079514
10	NC_010479	A	6	6	628	633	100 %	0 %	0 %	0 %	170079514
11	NC_010479	GAA	2	6	641	646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079515
12	NC_010479	AGG	2	6	713	718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079515
13	NC_010479	TAC	2	6	734	739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079515
14	NC_010479	CAG	2	6	792	797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079515
15	NC_010479	A	6	6	801	806	100 %	0 %	0 %	0 %	170079515
16	NC_010479	GCA	2	6	883	888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079515
17	NC_010479	AGTA	2	8	969	976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010479	GAG	2	6	990	995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010479	AGG	2	6	1054	1059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010479	TAT	2	6	1116	1121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010479	TTG	2	6	1128	1133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010479	AGA	2	6	1157	1162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010479	TAA	2	6	1168	1173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010479	GCT	2	6	1176	1181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010479	TAAG	2	8	1210	1217	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010479	CT	3	6	1307	1312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010479	CGC	2	6	1334	1339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_010479	G	6	6	1394	1399	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010479	GTC	2	6	1414	1419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010479	CG	3	6	1420	1425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010479	CAC	2	6	1522	1527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_010479	GCC	2	6	1573	1578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_010479	CCA	2	6	1602	1607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_010479	CCG	2	6	1716	1721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_010479	CCT	2	6	1753	1758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010479	AAGC	2	8	1806	1813	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010479	T	7	7	1844	1850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010479	GGC	2	6	1859	1864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010479	TAG	2	6	1872	1877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010479	AG	5	10	1876	1885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010479	GGGT	2	8	1886	1893	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010479	T	7	7	1918	1924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010479	T	6	6	2070	2075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010479	GCGG	2	8	2208	2215	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_010479	CTA	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010479	TC	4	8	2416	2423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010479	AGG	2	6	2557	2562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010479	C	6	6	2576	2581	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_010479	AAC	2	6	2589	2594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010479	GAA	2	6	2713	2718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079516
51	NC_010479	GAAT	2	8	2853	2860	50 %	25 %	25 %	0 %	170079516
52	NC_010479	CTG	2	6	2922	2927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079516
53	NC_010479	GGGA	2	8	2962	2969	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010479	GGC	2	6	3003	3008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079517
55	NC_010479	C	6	6	3022	3027	0 %	0 %	0 %	100 %	170079517
56	NC_010479	TGT	2	6	3050	3055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079517
57	NC_010479	TTG	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079517
58	NC_010479	ACC	2	6	3091	3096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079517
59	NC_010479	CTTGC	2	10	3276	3285	0 %	40 %	20 %	40 %	170079518
60	NC_010479	ACA	2	6	3291	3296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079518
61	NC_010479	ACA	2	6	3342	3347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079518
62	NC_010479	TGC	2	6	3526	3531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079518
63	NC_010479	AGA	2	6	3616	3621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079518
64	NC_010479	AGGC	2	8	3672	3679	25 %	0 %	50 %	25 %	170079518
65	NC_010479	ATG	2	6	3680	3685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079518
66	NC_010479	TTA	2	6	3726	3731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079518
67	NC_010479	ACT	2	6	3735	3740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079518
68	NC_010479	CCTA	2	8	3780	3787	25 %	25 %	0 %	50 %	170079518
69	NC_010479	CCT	2	6	3811	3816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_010479	CAA	2	6	3911	3916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079519
71	NC_010479	CAGA	2	8	4005	4012	50 %	0 %	25 %	25 %	170079519
72	NC_010479	AAG	2	6	4048	4053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079519
73	NC_010479	TGGA	2	8	4089	4096	25 %	25 %	50 %	0 %	170079519
74	NC_010479	GAAC	2	8	4136	4143	50 %	0 %	25 %	25 %	170079519
75	NC_010479	GAACC	2	10	4158	4167	40 %	0 %	20 %	40 %	170079519
76	NC_010479	TGA	2	6	4175	4180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079519
77	NC_010479	AGTC	2	8	4255	4262	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010479	AGC	2	6	4341	4346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079520
79	NC_010479	CAC	2	6	4393	4398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079520
80	NC_010479	AGA	2	6	4426	4431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079520
81	NC_010479	CCT	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079521
82	NC_010479	CTGCC	2	10	4629	4638	0 %	20 %	20 %	60 %	170079521
83	NC_010479	ATCC	2	8	4805	4812	25 %	25 %	0 %	50 %	170079521
84	NC_010479	TCA	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010479	ACC	2	6	5052	5057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079522
86	NC_010479	AAGG	2	8	5108	5115	50 %	0 %	50 %	0 %	170079522
87	NC_010479	AGC	2	6	5184	5189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010479	A	6	6	5286	5291	100 %	0 %	0 %	0 %	170079523
89	NC_010479	A	8	8	5328	5335	100 %	0 %	0 %	0 %	170079523
90	NC_010479	GAA	2	6	5337	5342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079523
91	NC_010479	ACT	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079523
92	NC_010479	AGA	2	6	5402	5407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079523
93	NC_010479	GCA	2	6	5410	5415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079523
94	NC_010479	GCG	2	6	5478	5483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079523
95	NC_010479	TCG	2	6	5533	5538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010479	TAG	2	6	5540	5545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010479	TA	3	6	5634	5639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010479	AGC	2	6	5742	5747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079524
99	NC_010479	CCG	2	6	5762	5767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079524
100	NC_010479	T	6	6	5780	5785	0 %	100 %	0 %	0 %	170079524
101	NC_010479	AGA	2	6	6033	6038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079524
102	NC_010479	A	6	6	6042	6047	100 %	0 %	0 %	0 %	170079524
103	NC_010479	GAC	2	6	6085	6090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079524
104	NC_010479	GAC	2	6	6105	6110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079524
105	NC_010479	GAC	2	6	6125	6130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079524
106	NC_010479	CA	3	6	6143	6148	50 %	0 %	0 %	50 %	170079524
107	NC_010479	CAAT	2	8	6150	6157	50 %	25 %	0 %	25 %	170079524
108	NC_010479	CCT	2	6	6190	6195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079524
109	NC_010479	TA	3	6	6211	6216	50 %	50 %	0 %	0 %	170079524
110	NC_010479	AG	5	10	6243	6252	50 %	0 %	50 %	0 %	170079524
111	NC_010479	A	6	6	6272	6277	100 %	0 %	0 %	0 %	170079524
112	NC_010479	TGC	2	6	6324	6329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079524
113	NC_010479	CAA	2	6	6403	6408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079524
114	NC_010479	TTA	2	6	6451	6456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079524
115	NC_010479	TGGT	2	8	6501	6508	0 %	50 %	50 %	0 %	170079524
116	NC_010479	TC	3	6	6640	6645	0 %	50 %	0 %	50 %	170079524
117	NC_010479	A	6	6	6736	6741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010479	C	6	6	6772	6777	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_010479	GGA	2	6	6807	6812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010479	CGG	2	6	6845	6850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079525
121	NC_010479	ACC	3	9	6903	6911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079525
122	NC_010479	GC	3	6	6933	6938	0 %	0 %	50 %	50 %	170079525
123	NC_010479	GGAG	2	8	6954	6961	25 %	0 %	75 %	0 %	170079525
124	NC_010479	TTC	2	6	6978	6983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079525
125	NC_010479	CTA	2	6	7016	7021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079525
126	NC_010479	CAA	2	6	7026	7031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079525
127	NC_010479	TCA	2	6	7045	7050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079525
128	NC_010479	CAGG	2	8	7080	7087	25 %	0 %	50 %	25 %	170079525
129	NC_010479	AAC	2	6	7250	7255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079525
130	NC_010479	CGC	2	6	7268	7273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079525
131	NC_010479	TAT	2	6	7313	7318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079525
132	NC_010479	GGCGAT	2	12	7431	7442	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	170079525
133	NC_010479	GCG	2	6	7581	7586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079525
134	NC_010479	CAC	2	6	7611	7616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079525
135	NC_010479	CAA	2	6	7617	7622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079525
136	NC_010479	AGT	2	6	7645	7650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010479	CCG	2	6	7689	7694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_010479	CAT	2	6	7710	7715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010479	GA	3	6	7785	7790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010479	CAGG	2	8	7916	7923	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010479	AAT	2	6	7928	7933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010479	GTCC	2	8	7971	7978	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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150	NC_010479	AACT	2	8	8446	8453	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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233	NC_010479	A	7	7	13344	13350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_010479	ATG	2	6	15376	15381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079535
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270	NC_010479	CAACAG	2	12	15496	15507	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	170079535
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